食品质量与安全系是在2015年6月经吉林大学优化调整相关学科，整合后成立的，隶属于吉林大学工学部，办学地点位于吉林大学西校区。

食品质量与安全专业历史悠久，源于中国人民解放军兽医大学在1978年建立的兽医食品卫生检验专业。1984年兽医大学成立兽医食品卫生检验系，并成为该专业我国首批硕士学位授权点。1987年，被授予全军动物性食品检测中心，之后成为国家首批动物性食品卫生检验博士授予点。2004年，原中国人民解放军军需大学转隶更名为吉林大学农学部，军需工程系改名为军需科技学院，招收首批食品质量与安全专业本科学生。转隶后，依托吉林大学“211工程”和“985工程”学校平台，依托食品科学与工程一级学科博士授权点和吉林省高校“十二五”优势特色重点建设学科，食品质量与安全专业实现了跨越式的发展。2015年，吉林大学学科优化调整，原吉林大学生物与农业工程学院与军需科技学院相关专业合并形成新的吉林大学食品质量与安全系。“十三五”期间，食质系教师承担国家自然科学基金项目、科技部重点研发专项、吉林省科技厅项目等百余项，科研经费累计达1500万元。科研成果产出丰富，获得省部级科技二等以上奖励4项、授权发明专利十余件，SCI论文年平均增长率达到20.21%。

本专业现有专职教师18人，其中教授7人，副教授9人，讲师2人；17人具有博士学位；拥有博士生导师7人，硕士生导师13人，教育部新世纪优秀人才1人； 14人具有海外工作或留学经历，10人具有博士后流动站工作经历；2021年5名教师获“匡亚明/唐敖庆学者”校内人才项目。

本专业教师秉承食品卫生检验的专业特色，主要开展食品营养与安全检测、食品安全控制理论与技术、食源性致病菌天然抗菌剂的筛选及机制研究、食品安全与人体健康等4个方向的研究。